Génétique et médecine génomique en inflammation
Au cours de la dernière décennie, nous avons été témoins d’une explosion de découvertes en génétique et en génomique. Ces dernières ont transformé notre aptitude à identifier les variantes génétiques menant à de rares maladies monogéniques et celles qui jouent un rôle clé dans le développement de maladies communes issues d’une interaction complexe entre de multiples facteurs de risque génétiques et non génétiques. Ces découvertes comprennent le séquençage du génome humain, et l’identification des dizaines de millions de variantes génétiques communes (différences dans le code génétique d’une personne à l’autre) et de la structure génétique du génome humain. De plus, des percées technologiques nous ont permis de tester des millions de variantes au cours d’une seule expérience, et des technologies ont rendu possible le séquençage du génome entier d’une personne en seulement quelques jours.
Description
L’un des plus grands défis auxquels nous faisons face aujourd’hui est de déterminer comment miser sur ces importantes découvertes pour améliorer la prévention des maladies et les soins de santé. Notre laboratoire a joué un rôle clé dans les découvertes génétiques citées ci-dessus et déploie tous les efforts pour relever cet important défi. Notre groupe continue de développer et d’implanter de nouvelles approches visant à identifier les facteurs de risque génétiques, à déterminer les composantes biologiques affectées par ces variantes génétiques et à intégrer toute cette information de manière à améliorer le diagnostic des maladies et les options de traitement. Nous utilisons une variété d’approches génétiques, génomiques et de biologie intégrative sur un ensemble varié de maladies inflammatoires, métaboliques et cardiovasculaires. Quelques-uns de nos projets sont cités ci-après. Pour une liste plus détaillée de nos projets et plateformes technologiques, veuillez visiter le site Web du laboratoire (voir le lien plus bas).
Membres de l'équipe
John D. Rioux, Directeur du laboratoire
Projets de recherche
Malgré les récents progrès en matière de traitement et de prévention des coronaropathies, la mort cardiaque subite (MCS) demeure un problème de santé publique majeur avec une incidence annuelle de 50 à 100 cas par 100 000 personnes dans la population générale. On estime que parmi tous les cas de MCS, 80 % sont associés à des coronaropathies, 10 à 15 % à des cardiomyopathies et 5 % à la myocardite, aux anomalies coronariennes ou aux canalopathies (p. ex. les syndromes du QT long, de Brugada et du QT court). Notre groupe tente d’identifier les variantes génétiques importantes dans les formes mendéliennes (familiales) de la MCS ainsi que dans ses formes plus polygéniques. Le but de ce travail est de permettre la prédiction et la prévention efficaces de la MCS.
Les maladies inflammatoires chroniques affectent environ 5 % de la population mondiale et incluent notamment la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse, le lupus et la sclérose en plaques. Au cours des dernières années, nous avons utilisé des études d’association pangénomiques afin d’identifier et de valider des centaines de facteurs de risque génétiques pour ces maladies. Nous avons aussi montré comment des approches de séquençage de nouvelle génération peuvent être utilisées pour identifier le gène causal et les variantes causales dans les loci associés. Pendant que nous poursuivons nos efforts visant à identifier systématiquement le plus grand nombre de facteurs de risque génétiques et à déterminer lesquels sont spécifiques à une maladie et lesquels jouent un rôle important dans plusieurs maladies, nous déployons beaucoup d’efforts pour comprendre la fonction des gènes par des approches faisant appel à la bioinformatique, à la génomique et à la biologie intégrative. Le but premier de nos travaux est de traduire des découvertes génétiques en une meilleure compréhension des systèmes biologiques complexes, en de meilleurs outils cliniques et de recherche, et en des traitements améliorés.
La maladie de Leigh de type canadien français est une maladie à transmission autosomique récessive qui mène à une déficience de la cytochrome c oxydase (COX). Les patients présentent des retards du développement, de l’hypotonie, une légère dysmorphologie faciale et un taux de mortalité élevé dans les cinq premières années de vie en raison d’épisodes graves de crises acidotiques et de coma. Il s’agit d’une maladie rare dans le monde, mais courante dans certaines régions du Québec, où le taux de portage est d’environ 1/22 et où la maladie affecte environ 1/2000 naissances vivantes. En 2001, notre équipe a mappé le locus de la maladie de Leigh de type canadien français. Puis, en 2003, elle a identifié les deux mutations du gène LRPPRC qui causent la maladie, rendant possible le dépistage prénatal. Depuis, nous avons formé un consortium regroupant des membres et des collaborateurs de partout en Amérique du Nord et en Europe. Ce groupe s’emploie à développer des outils de prédiction et des stratégies thérapeutiques visant à améliorer la survie et la qualité de vie des personnes atteinte de la maladie de Leigh de type canadien français.